По его мнению, «сравнительно богатую растительность замещают очень бедными еловыми монокультурами». «Это одна из больших проблем, ибо знаем, что долгосрочно у елей в Латвии не будет хороших перспектив, но, вопреки всему, их сажают. Очевидно с допущением, что в будущем их можно будет рубить в меньшем возрасте, в 40 лет, так решая вопрос, который создает ожидание, пока дерево достигнет 80 лет, ибо за это время ель могут сломать ветер или прикончить вредители. В свою очередь, вырубая вдвое моложе, за это время можно успеть сделать даже два раза».
«Второй вызов латвийской природе есть индустриализация ландшафта, - продолжает Я.Кюзе. - Мы теряем зелень, которая замещается пахотной землей. Латвийские луга в данный миг в очень угрожаемом положении. Третий вызов — то, что происходит в наших водах, эвтрофикация, перекрытие рек, дамбы. Эвтрофикация рек появляется с невыполнением требований буферных зон, пахотой на определенном расстоянии от канав, чтобы питательные вещества не попадали в канавы и не уходили в реки».
В настоящее время биолог реализует процесс выращивания морских орлов под Дурбе, где ведется онлайн-трансляция из гнезда. Уже насчитывается 18 миллионов просмотров. Прилетевшие из Эстонии птички стали любимцами орнитологов по всему миру, им даже посвящают доклады на международных конференциях. Янис Кюзис предупреждает, что ветряные электростанции нельзя строить на птичьих путях.